初中男孩和女孩的身高差异通常在3到5厘米之间。不过这个差异并不是固定的，因为身高的增长受到遗传、营养、运动和整体健康状况等多种因素的影响。

男孩在青春期早期（大约11-12岁）开始迅速长高，而女孩则在青春期早期（大约8-9岁）开始迅速长高。所以在青春期初期，男孩和女孩的身高差异可能会更大。但随着青春期的推进，这种差异可能会逐渐减小。

需要注意的是，个体差异很大，有的男孩可能比女孩高得多，也有的女孩可能比同龄男孩高。所以不能一概而论。