1、微生物控制:便是应用水蚤(鱼虫)把小球藻吞掉,应用前提条件是池中没有吃水蚤的淡水鱼等。

2、控制盐度:小球藻是窄盐性微生物,对盐度的提升很比较敏感,在水里放盐除去绿藻。

3、用除藻剂:尽管能够除藻,但由于是有害药物,对鱼对草都危害。