兼善中学本部与蔡家校区的区别为：占地面积不同、就读年级不同、教学班数量不同。

一、占地面积不同

1、兼善中学本部：兼善中学本部的占地面积为100.5亩。

2、兼善中学蔡家校区：兼善中学蔡家校区的占地面积为230亩。

二、就读年级不同

1、兼善中学本部：兼善中学本部的学生就读年级范围为高一和高二年级学生。

2、兼善中学蔡家校区：兼善中学蔡家校区的学生就读年级范围为高三年级学生。

三、教学班数量不同

1、兼善中学本部：兼善中学本部的教学班数量为共有89个教学班。

2、兼善中学蔡家校区：兼善中学蔡家校区的教学班数量为共有32个教学班。