自学考试（自考）完成后申请论文通常包括以下几个步骤：

确认成绩合格：

首先确保你已经完成了所有课程的学习，并且所有课程的成绩都达到了学校或主考院校规定的合格标准。

了解论文要求：

查阅你所在自考主考院校或所在地的自考办发布的论文申请要求和流程。这些信息通常可以在学校的官方网站或者相关的自考通知中找到。

准备论文题目：

根据你的专业和兴趣，选择一个合适的论文题目。题目应具有一定的学术价值和创新性。

提交论文申请：

按照要求准备相关材料，如论文申请表、成绩单、身份证等，然后提交给所在的主考院校或自考办。

导师分配：

学校或自考办会根据你的专业和论文题目为你分配导师。

论文开题：

与导师商讨确定论文的具体研究方向和提纲，并完成论文的开题报告。

撰写论文：

根据开题报告，开始撰写论文。在撰写过程中，需要定期与导师沟通，及时反馈进展和遇到的问题。

论文答辩：

论文完成后需要准备论文答辩。答辩通常包括论文的口头报告和答辩委员会的提问。

提交论文：

经过答辩并通过后，按照要求提交最终论文。

以下是具体步骤的详细说明：

准备材料：准备论文申请表、身份证复印件、准考证复印件、成绩单等。

提交申请：将准备好的材料提交给所在地的自考办或主考院校。

等待审核：提交材料后，等待自考办或主考院校的审核。

导师分配：审核通过后，学校会为你分配导师。

撰写论文：在导师的指导下完成论文撰写。

论文答辩：完成论文后，参加论文答辩。

论文提交：答辩通过后，按照要求提交论文。

需要注意的是具体的申请流程和要求可能会因地区和主考院校的不同而有所差异，建议你及时关注所在学校的官方通知或咨询自考办获取最准确的信息。